กรดสควอริกสีขาวเป็นผลึกเม็ดสีเบจที่มีความเป็นกรดที่แข็งแกร่ง pkl = 1.5; pK2=3.5。 ด้วยเฟอร์ริกคลอไรด์สารละลายน้ําผลิตสีม่วงเข้ม มันสามารถออกซิไดซ์โดยโบรมีนและด่างทับทิมและไม่ทําปฏิกิริยากับฟีนิลไฮดราซีน เช่นเดียวกับกรดคาร์บอกซิลิกในธรรมชาติมันสามารถเค็มกับด่างเพื่อผลิตเอสเตอร์อะซิลคลอไรด์อะไมด์และแอนไฮไดรด์ผสม มันสามารถใช้เป็นรีเอเจนต์ acylation สําหรับปฏิกิริยา acylation กับแหวนอะโรมาติกที่เปิดใช้งานด้วยไฟฟ้า มันทําปฏิกิริยากับพันธะคู่ที่ใช้งานและกลุ่มเมทิลในการผลิตสารประกอบใหม่ที่มีคุณสมบัติพิเศษ. จัดทําขึ้นจาก 1,1,2,2-tetrafluoro-3,3,4,4-tetrachlorocyclobutane หรือ perchloric-1,3-butadiene
ใช้เป็นน้ํายาอะซิเลชั่นสําหรับปฏิกิริยาอะซิเลชั่นด้วยวงแหวนอะโรมาติกที่เปิดใช้งานด้วยไฟฟ้า ทําปฏิกิริยากับพันธะคู่ที่ใช้งานอยู่และกลุ่มเมทิลที่ใช้งานอยู่เพื่อสร้างสารประกอบใหม่ที่มีคุณสมบัติเฉพาะ มันสามารถใช้เป็นรีเอเจนต์ acylation สําหรับปฏิกิริยา acylation กับแหวนอะโรมาติกที่เปิดใช้งานด้วยไฟฟ้า มันทําปฏิกิริยากับพันธะคู่ที่ใช้งานและกลุ่มเมทิลในการผลิตสารประกอบใหม่ที่มีคุณสมบัติที่ไม่ซ้ํากัน. ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์ตัวนําแสงอินทรีย์วัสดุแสดงผลผลึกเหลวการเขียนด้วยเลเซอร์และวัสดุบันทึกและวัสดุตัวรับแสงถ่ายภาพไฟฟ้าสถิต
การประยุกต์ใช้สีย้อมไซยานีนสี่เหลี่ยมในการถ่ายภาพการติดฉลากโปรตีน: วิธีการถ่ายภาพโมเลกุลได้กลายเป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพอย่างรวดเร็วสําหรับการวิจัยทางชีวภาพการพัฒนายาและการวินิจฉัยทางคลินิก มันสามารถใช้สําหรับเป้าหมายธรรมชาติและวิธีการถ่ายภาพเรืองแสงและมีการเลือกและความไวต่อการถ่ายภาพโมเลกุล อย่างไรก็ตามสําหรับเนื้อเยื่อหรือการถ่ายภาพเซลล์ใน vivo การดูดซึมและการปล่อยสีย้อมเรืองแสงสูงสุดเป็นที่ต้องการในภูมิภาคใกล้อินฟราเรดเนื่องจากบริเวณความยาวคลื่นนี้มีการรบกวนทางชีวโมเลกุลเล็กน้อยการเรืองแสงที่เกิดขึ้นเองต่ําการเจาะเนื้อเยื่อที่ดีและความเป็นพิษต่อแสงต่ําต่อเซลล์ เพราะกรดสควอริกสามารถติดฉลากในโปรตีนมันมีบทบาทสําคัญในการรักษาเนื้องอกและหูด
การประยุกต์ใช้สีย้อมไซยานีนสแควร์ในการวินิจฉัยและการรักษาเครื่องหมายเนื้องอก: ในการตรวจจับการถ่ายภาพเรืองแสงของแผลเนื้องอกสีย้อมฟลูออเรสเซนต์ใกล้อินฟราเรดสามารถปรับเปลี่ยนเพื่อกําหนดเป้าหมายโมเลกุลที่รู้จักตัวรับเฉพาะของเซลล์เนื้องอก เมื่อนําไปใช้กับการวินิจฉัยและการรักษาเนื้องอกโพรบใกล้อินฟราเรดที่แก้ไขแล้วจะกําหนดเป้าหมายเนื้อเยื่อหรือช่องที่มะเร็งตั้งอยู่ โมเลกุลเป้าหมายทั่วไปคือแอนติบอดีโมเลกุลโพลีเปปไทด์บางโมเลกุล ด้วยความจําเพาะความไวของการตรวจจับเรืองแสงจะดีขึ้นอย่างมาก หากตรวจพบเซลล์มะเร็งในระยะแรกของมะเร็งจะเอื้อต่อการรักษามาก อย่างไรก็ตามการระบุเซลล์มะเร็งจากเซลล์ปกติและเลือกฆ่าเซลล์มะเร็งยังคงเป็นเป้าหมายหลักของการพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี สีย้อมไซยานีนสี่เหลี่ยมบางสีได้รับการพิสูจน์แล้วว่าไวแสงสําหรับ PDT (การบําบัดด้วยแสง) PDT เป็นเทคโนโลยีใหม่สําหรับการวินิจฉัยโรคและการรักษาโดยใช้ผลทางแสง หลักการพื้นฐานคือการผลิตสารพิษและออกซิเจนชนิดปฏิกิริยาภายใต้การกระตุ้นของสารกระตุ้น กระบวนการคือกรดสควอริกถูกดูดซึมโดยเนื้อเยื่อจะตื่นเต้นภายใต้การฉายรังสีของแสงกระตุ้นของความยาวคลื่นที่เฉพาะเจาะจง ตัวไวแสงจะส่งพลังงานไปยังออกซิเจนโดยรอบเพื่อสร้างออกซิเจนเดี่ยวที่ใช้งานสูง ออกซิเจนเดี่ยวทําปฏิกิริยากับโมเลกุลทางชีวภาพที่อยู่ติดกันเพื่อสร้างความเป็นพิษต่อเซลล์ซึ่งทําลายการทํางานปกติของเซลล์และทําให้เซลล์ตาย