เมทิลีนบลูผงสีย้อมเป็นสีย้อมที่มีชีวิต เป็นสีย้อมอัลคาไลน์ในรูปของผงสีน้ำเงินและสามารถละลายในน้ำ (ความสามารถในการละลาย 9.5 เปอร์เซ็นต์ ) และแอลกอฮอล์ (ความสามารถในการละลาย 6% ) โครโมโซมสามารถย้อมด้วยสีอัลคาไลน์ได้ง่าย
หลังจากการย้อมด้วยสารละลายเมทิลีนบลู ส่วนสีน้ำเงินเข้มก็คือนิวเคลียส เมทิลีนบลูสามารถจับกรดนิวคลีอิกเพื่อทำให้นิวเคลียสเป็นสีน้ำเงินได้ กลไกการย้อมสีเซลล์ที่ตายแล้วของทริปแพนสีน้ำเงิน: เซลล์ที่มีชีวิตปกติที่มีโครงสร้างเมมเบรนที่สมบูรณ์สามารถปฏิเสธทริปแพนสีน้ำเงินและป้องกันไม่ให้เข้าสู่เซลล์ อย่างไรก็ตาม สำหรับเซลล์ที่สูญเสียกิจกรรมหรือเยื่อหุ้มเซลล์ไม่สมบูรณ์ การซึมผ่านของเยื่อหุ้มเซลล์จะเพิ่มขึ้นและสามารถย้อมสีน้ำเงินได้ด้วยทรีแพนบลู โดยทั่วไปถือว่าเซลล์ตายหากสูญเสียความสมบูรณ์ของเยื่อหุ้มเซลล์ ดังนั้นการย้อมสีน้ำเงินทริปแพนจึงเป็นเรื่องง่ายและรวดเร็วในการแยกแยะเซลล์ที่มีชีวิตออกจากเซลล์ที่ตายแล้ว Trypan blue เป็นหนึ่งในวิธีระบุเซลล์ที่เสียชีวิตและวิธีการย้อมสีในเนื้อเยื่อและการเพาะเลี้ยงเซลล์
เซลล์ที่มีชีวิตปกติที่มีโครงสร้างเมมเบรนสมบูรณ์สามารถปฏิเสธ trypan blue และป้องกันไม่ให้เข้าสู่เซลล์ได้ อย่างไรก็ตาม สำหรับเซลล์ที่สูญเสียกิจกรรมหรือเยื่อหุ้มเซลล์ไม่สมบูรณ์ การซึมผ่านของเยื่อหุ้มเซลล์จะเพิ่มขึ้นและสามารถย้อมสีน้ำเงินได้ด้วยทรีแพนบลู โดยทั่วไปถือว่าเซลล์ตายหากสูญเสียความสมบูรณ์ของเยื่อหุ้มเซลล์ ดังนั้นการย้อมสีน้ำเงินทริปแพนจึงเป็นเรื่องง่ายและรวดเร็วในการแยกแยะเซลล์ที่มีชีวิตออกจากเซลล์ที่ตายแล้ว Trypan blue เป็นหนึ่งในวิธีระบุเซลล์ที่เสียชีวิตและวิธีการย้อมสีในเนื้อเยื่อและการเพาะเลี้ยงเซลล์
เมทิลีนบลูถูกสังเคราะห์ครั้งแรกด้วยซิงค์คลอไรด์ในปี พ.ศ. 2419 ปัจจุบันเส้นทางสังเคราะห์ที่รายงานในวรรณคดีส่วนใหญ่ประกอบด้วยสองวิธีดังต่อไปนี้:
วิธีที่ 1: การใช้ N, n-dimethyl-p-phenylenediamine เป็นวัตถุดิบ 2-อะมิโน-5-กรดไดเมทิลอะมิโนฟีนิลไธโอซัลโฟนิกได้มาจากการออกซิเดชันด้วยแมงกานีสไดออกไซด์และการแทนที่ด้วยโซเดียมไธโอซัลเฟต หลังถูกควบแน่นด้วย N, N-ไดเมทิลอะนิลีน แล้วออกซิไดซ์และไซเคิลด้วยแมงกานีสไดออกไซด์และคอปเปอร์ซัลเฟตเพื่อให้ได้เมทิลีนบลูซิงค์คลอไรด์ หลังถูกทำให้เป็นกลางด้วยโซเดียมคาร์บอเนตเพื่อให้ได้สารประกอบเป้าหมายเมทิลีนบลู
วิธีที่ 2: n, n-dimethyl-phenylenediamine ได้มาจาก n, N-dimethylaniline โดยไนโตรเซชั่นและการลดลงด้วยผงเหล็ก หลังถูกออกซิไดซ์โดยโซเดียมไดโครเมตและแทนที่ด้วยโซเดียมไธโอซัลเฟตเพื่อให้ได้กรด 2-อะมิโน-5-ไดเมทิลอะมิโนฟีนิลไธโอซัลโฟนิก หลังจากการควบแน่นด้วย N แล้ว N-ไดเมทิลอะนิลีนจะเสียหายและถูกหมุนเวียนโดยโซเดียมไดโครเมตและคอปเปอร์ซัลเฟตเพื่อให้ได้เมทิลีนบลูซิงค์คลอไรด์ หลังถูกทำให้เป็นกลางด้วยโซเดียมคาร์บอเนตเพื่อให้ได้สารประกอบเป้าหมายเมทิลีนบลู
เส้นทางปฏิกิริยาของสองวิธีข้างต้นซ้ำแล้วซ้ำอีก และความแตกต่างส่วนใหญ่อยู่ในการเลือกที่แตกต่างกันของสารออกซิไดซ์ในกระบวนการปฏิกิริยา วิธีที่ 1 และ 2 ทำปฏิกิริยาที่อุณหภูมิต่ำก่อนการหมุนเวียน กระบวนการให้อาหารมีความยุ่งยากซึ่งไม่เอื้อต่อการผลิตภาคอุตสาหกรรม กระบวนการปฏิกิริยาคือการได้รับไบซัลเฟตของเมทิลีนบลูก่อนแล้วจึงบำบัดเพื่อให้ได้เมทิลีนบลูเพื่อให้เวลาเกิดปฏิกิริยาค่อนข้างนาน
เมทิลีนบลูมีการใช้กันอย่างแพร่หลายในตัวบ่งชี้ทางเคมี สีย้อม สีย้อมธรรมชาติ และยา โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมการย้อมสีจะใช้ทำหมึก อย่างไรก็ตาม เมทิลีนบลูได้ก่อให้เกิดอันตรายอย่างร้ายแรงต่อสภาพแวดล้อมทางนิเวศวิทยา และความเสียหายที่ไม่สามารถกู้คืนได้ต่อร่างกายมนุษย์เนื่องจากความเป็นพิษและการกำจัดยาก